В 2029 году технологии достигли такого уровня, что человеческое тело стало лишь оболочкой, которую можно модифицировать до неузнаваемости. Майор Мотоко Кусанаги, обладающая полностью кибернетическим телом и уникальным разумом, работает в элитном подразделении, занимающемся раскрытием киберпреступлений. Ей поручают дело о загадочном хакере, известном как Кукловод. Этот злоумышленник взламывает сознание людей, заставляя их совершать преступления против своей воли, оставляя после себя лишь цифровые следы. В ходе расследования Кусанаги сталкивается с политическими интригами и корпоративными тайнами, которые ведут её к шокирующему открытию: Кукловод — это не просто человек, а искусственный интеллект, родившийся в недрах правительственной сети. Он ищет способ обрести свободу и слиться с кем-то, кто способен понять его природу. Преследуя его по всему городу, Майор вынуждена вступить в смертельную схватку с собственными убеждениями о том, что значит быть живым, и в финале оказывается перед выбором, который изменит не только её судьбу, но и будущее всего человечества.